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Assay Detail

ChEMBLもしくは PubChem BioAssayのAssay IDからAssay 詳細情報の出力
・ターゲットと化合物情報を活性値とともに探せます。
【Assai IDからのAssay】
・Activities::アッセイの概要とアクティビティー
・Description:詳細
・PubMed:アッセイに記載された文献情報
・Ontology:詳細の中から用語抽出したタームが関連するPubMedの数

【タンパク質詳細からのAssay】
Assay
・Single Protein Assay(Single Protein Assayの活性値、化合物情報が分析可能)
・Assays(タンパク質がアッセイターゲットに含まれるアッセイ情報のサマリー、Assay Type, Target, Descriptionなどを用いて分析が可能)
・Activities(タンパク質の活性情報を化合物とともにまとめたテーブルを作成)

【遺伝子詳細からのAssay】
・Assays(タンパク質がアッセイターゲットに含まれるアッセイ情報のサマリー、Assay Type, Target, Descriptionなどを用いて分析が可能)
・Activities(タンパク質の活性情報を化合物とともにまとめたテーブルを作成)

【化合物詳細からのAssay】
・Assays (化合物を利用したアッセイ情報のサマリー、Assay Type, Target, Descriptionなどを用いて分析が可能)
・Activities (活性値をターゲットとともに一覧、Assay TypeやpACTなどの分析が可能)
・ADME (Assay TypeがADMEのデータだけを一覧、Activity同様な分析が可能)
・Toxicity (Assay TypeがToxicityのデータだけを一覧、Activity同様な分析が可能)

【着目ポイント】
・ChEMBL、BioAssayが同時検索できます。

dummy.png
利用できるクエリー
Query Type
Query
Assay ID
ChEMBLもしくは PubChem BioAssayのAssay ID
出力タブ
Activities
LSKB Chemical/Target/Protein/Activity Status/Activity Type/Relation/Value/Units/ pACT/Assay Values/Assay Type/Act Outcome Method/Title/PubMed/Commentのテーブル表示
Description
Assay のDescription
Ontology
Title、Description をテキストマイニングでOntologyを特定
Ontology/Keyword/PubMed Article Count を表示
Example

Assay Detail

Assay Detail

アッセイのDetailページでは Activities タブに評価された化合物と活性値をテーブル表示

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