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Assay Detail
ChEMBLもしくは PubChem BioAssayのAssay IDからAssay 詳細情報の出力
・ターゲットと化合物情報を活性値とともに探せます。
【Assai IDからのAssay】
・Activities::アッセイの概要とアクティビティー
・Description:詳細
・PubMed:アッセイに記載された文献情報
・Ontology:詳細の中から用語抽出したタームが関連するPubMedの数
【タンパク質詳細からのAssay】
Assay
・Single Protein Assay(Single Protein Assayの活性値、化合物情報が分析可能)
・Assays(タンパク質がアッセイターゲットに含まれるアッセイ情報のサマリー、Assay Type, Target, Descriptionなどを用いて分析が可能)
・Activities(タンパク質の活性情報を化合物とともにまとめたテーブルを作成)
・
【遺伝子詳細からのAssay】
・Assays(タンパク質がアッセイターゲットに含まれるアッセイ情報のサマリー、Assay Type, Target, Descriptionなどを用いて分析が可能)
・Activities(タンパク質の活性情報を化合物とともにまとめたテーブルを作成)
【化合物詳細からのAssay】
・Assays (化合物を利用したアッセイ情報のサマリー、Assay Type, Target, Descriptionなどを用いて分析が可能)
・Activities (活性値をターゲットとともに一覧、Assay TypeやpACTなどの分析が可能)
・ADME (Assay TypeがADMEのデータだけを一覧、Activity同様な分析が可能)
・Toxicity (Assay TypeがToxicityのデータだけを一覧、Activity同様な分析が可能)
【着目ポイント】
・ChEMBL、BioAssayが同時検索できます。
利用できるクエリー
Query Type | Query |
---|---|
Assay ID | ChEMBLもしくは PubChem BioAssayのAssay ID |
出力タブ
Activities
LSKB Chemical/Target/Protein/Activity Status/Activity Type/Relation/Value/Units/ pACT/Assay Values/Assay Type/Act Outcome Method/Title/PubMed/Commentのテーブル表示
Description
Assay のDescription
Ontology
Title、Description をテキストマイニングでOntologyを特定
Ontology/Keyword/PubMed Article Count を表示
Example
Assay Detail
アッセイのDetailページでは Activities タブに評価された化合物と活性値をテーブル表示
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